A novel network science and similarity-searching-based approach for discovering potential antiviral peptides / Daniela De Llano García; tutor Hortensia María Rodríguez Cabrera
Tipo de material:
TextoIdioma: Inglés Idioma del resumen: Español Fecha de copyright: Urcuquí, 2023Descripción: 141 hojas : ilustraciones (algunas a color) ; 30 cm + 1 CD-ROMTema(s): Recursos en línea: Nota de disertación: Trabajo de integración curricular (Químico/a). Universidad de Investigación de Tecnología Experimental Yachay. Urcuquí, 2023 Resumen: Los péptidos antivirales (AVP, por sus siglas en inglés) poseen un gran potencial como fármacos contra las infecciones virales. Sin embargo, la cantidad de información disponible supera la capacidad de interpretación de los investigadores. Para abordar este desafío, se utilizó la minería interactiva de datos y las facilidades de las redes de espacio proximal a través del software StarPep para explorar el espacio químico de los AVPs. Adicionalmente, se utilizó el algoritmo de clustering de Louvain para crear un perfil basado en las comunidades obtenidas, revelando así características biológicas, patrones y diferentes relaciones entre los péptidos. Esta exploración fue extendida a través de las redes de metadato (MN) que aportó importante información sobre "bases de datos", "función", "origen" y "objetivo". Este análisis permitió detectar nuevas interconexiones, enriqueciendo la comprensión de los AVPs y sus características. Para crear representaciones simplificadas del espacio químico, se realizó un proceso de extracción de scaffold que resultó en cuatro subconjuntos definidos que conservan las características centrales mientras simplifican la complejidad de la red. Como resultado, reportamos 33 potenciales motivos antivirales, de los cuales 23 son completamente novedosos para el campo. Además, se desarrollaron cinco Modelos de Búsqueda por Similitud Múltiple que fueron comparados y superaron 14 diferentes predictores disponibles en la literatura. Sobre estos hallazgos mencionados se encontraron 46 potenciales secuencias antivirales derivadas de diferentes bases de datos que juntas contenían más de 100,000 secuencias. Este trabajo no solo proporciona información valiosa sobre las características de los AVP sino que también sienta las bases para el desarrollo de péptidos con uso terapéutico.
| Tipo de ítem | Biblioteca actual | Signatura | Copia número | Estado | Fecha de vencimiento | Código de barras | Reserva de ítems | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Tesis
|
Biblioteca Yachay Tech | ECQI0155 (Navegar estantería(Abre debajo)) | 1 | No para préstamo | T000619 |
Trabajo de integración curricular (Químico/a). Universidad de Investigación de Tecnología Experimental Yachay. Urcuquí, 2023
Incluye referencias bibliográficas (páginas 98-119)
Trabajo de integración curricular con acceso abierto
Texto (Hypertexto links)
Los péptidos antivirales (AVP, por sus siglas en inglés) poseen un gran potencial como fármacos contra las infecciones virales. Sin embargo, la cantidad de información disponible supera la capacidad de interpretación de los investigadores. Para abordar este desafío, se utilizó la minería interactiva de datos y las facilidades de las redes de espacio proximal a través del software StarPep para explorar el espacio químico de los AVPs. Adicionalmente, se utilizó el algoritmo de clustering de Louvain para crear un perfil basado en las comunidades obtenidas, revelando así características biológicas, patrones y diferentes relaciones entre los péptidos. Esta exploración fue extendida a través de las redes de metadato (MN) que aportó importante información sobre "bases de datos", "función", "origen" y "objetivo". Este análisis permitió detectar nuevas interconexiones, enriqueciendo la comprensión de los AVPs y sus características. Para crear representaciones simplificadas del espacio químico, se realizó un proceso de extracción de scaffold que resultó en cuatro subconjuntos definidos que conservan las características centrales mientras simplifican la complejidad de la red. Como resultado, reportamos 33 potenciales motivos antivirales, de los cuales 23 son completamente novedosos para el campo. Además, se desarrollaron cinco Modelos de Búsqueda por Similitud Múltiple que fueron comparados y superaron 14 diferentes predictores disponibles en la literatura. Sobre estos hallazgos mencionados se encontraron 46 potenciales secuencias antivirales derivadas de diferentes bases de datos que juntas contenían más de 100,000 secuencias. Este trabajo no solo proporciona información valiosa sobre las características de los AVP sino que también sienta las bases para el desarrollo de péptidos con uso terapéutico.
Textos en inglés con resúmenes en español e inglés
No hay comentarios en este titulo.